بدأ المعهد الحديث بتنفيذ الإجراءات المطلوبة للوقاية من مرض H1N1 مع بداية العام الدراسي الجديد، حيث علّقت الملصقات الإرشادية لتوجيه جميع الطلاب والموظفين والمدرسين إلى الاحتياطات اللازمة للوقاية من المرض. كما كلّفت لجنة خاصة بقياس درجة حرارة كل من يدخل المعهد باستخدام الأجهزة الخاصة بذلك في كل الفروع (مدينة عيسى، مدينة حمد، أم الحصم، عراد)، وعمّمت كذلك خطة العزل التي ستنفّذ على أي شخص يشير الجهاز لارتفاع درجة حرارته، وتوفر إدارة المعـــهد منذ بدايـــــة تأسيســه مرافــــق صحية ملائمة، وأدوات التنظيف الصحية المطلوبة، وقد وفّرت الإدارة علاوة على ذلك المواد المعقّمة والمطهّرة لليدين والهواء والأرضيات.