مهاجم فريق نادي المحرق ومنتخب البحرين الوطني لكرة القدم.

بدأ مشواره في كرة القدم العام 1987 حينما إنضم إلى مدرسة الكرة في نادي المحرق بإشراف المدربين الوطنيين جاسم محمد وعلي بوزبون.

انضم محمد جعفر إلى فريق الناشئين بإشراف المدرب أحمد سالمين، وانتقل بعدها إلى فريق الشباب واستقر بعدها في الفريق الأول العام 1995.

شارك مع المنتخبات البحرينية للناشئين والشباب والاولمبي والاول.

ساهم محمد جعفر في تأهل منتخب البحرين إلى الدور الحاسم من التصفيات الآسيوية في نهائي مونديال 2002 لأول مرة، بعدما تسبب في ركلة الجزاء التي جاء منها هدف الفوز البحريني على الكويت في ختام الدور الأول.

ساهم في تحقيق العديد من البطولات مع ناديه المحرق، أبرزها لقب الدوري وكأس سمو ولي العهد موسم 2000-2001 والدوري وكأس الملك موسم 94-95 وكأس الملك موسمي 95-96 و 96-97 والدوري موسم 98-99.

تألق في الموسم الماضي حيث توّج هدافا للدوري برصيد 25 هدفا، وهدافا لكأس الملك برصيد 9 أهداف ليحصل بذلك على جائزة هداف العرب التي تقدمها مجلة «الحدث الرياضي» اللبنانية سنويا، وأصبح أول لاعب بحريني ينال هذه الجائزة