كشف «التقرير الاستراتيجي البحريني 2009» الصادر عن مركز البحرين للدراسات والبحوث عن تصاعد عامل الطائفية في البحرين في الأعوام الأخيرة، الأمر الذي جعل تفسير الكثير من الأحداث من منظور طائفي، بحسب التقرير. وأكد التقرير وجود 12 قضية مهمة طُرحت خلال العامين 2008 - 2009، تقدمتها: البيئة، الجامعات الخاصة والتعليم العالي في البحرين، حرية الصحافة، البطالة، وغيرها. ولفت إلى أن المشهد الداخلي «يتأثر بعاملين خطيرين» أولهما العامل الطائفي الذي تصاعدت حدته في السنوات الأخيرة، والثاني هو العامل الخارجي، الذي يقوم على إلقاء اللائمة على فكرة الاستعمار والصهيونية و «إسرائيل» وأميركا حتى يمكن إراحة النفس من أي اتهام بالتقصير أو الإهمال