على رغم أن المستوى التحكيمي كان جيداً بصورة عامة خلال مباريات الجولة الأولى للدوري إلاّ أن هناك بعض الملاحظات والوقفات المتعلقة بهذا الجانب، إذ تم رصد بعض الحالات، الأولى كانت باحتساب هدف غير صحيح لفريق البحرين في مرمى الحد بعدما أثبتت الصور أن مهاجم البحرين عبدالله جناحي حول الكرة بيده داخل مرمى الحد على طريقة الأسطورة الأرجنتينية دييجو مارادونا في مباراة الأرجنتين وانجلترا في ربع نهائي مونديال 1986، كما أن اللاعب جناحي اعترف بذلك خلال تصريحه لـ «الوسط الرياضي» في اليوم التالي للمباراة.

أما الحالة الثانية فكانت حالة طرد مدافع نادي الشباب محمود منصور في مباراة فريقه والمحرق إذ لم تستدع الحالة قرار الطرد وخصوصاً أن وضع منصور ومهاجم المحرق حسين علي بيليه كان في كرة مشتركة والكرة ابتعدت عنهما نحو الحارس الشبابي.