يقدم مجلس التعليم العالي 10 خدمات تتنوع بين طلابية ومؤسسية، إذ تختص الخدمات الطلابية المقدمة في إصدار إفادة مصدقة بشأن المؤهلات العلمية الممنوحة من مؤسسات التعليم العالي الخاصة المرخصة من حكومة مملكة البحرين: أي اعتماد المؤهل العلمي للطالب، إصدار إفادة مصدقة مترجمة: وهي خدمة ترجمة الإفادة الصادرة بعد التصديق على المؤهل العلمي، إصدار إفادة بدل فاقد/طبق الأصل: أي إصدار نسخ من الإفادة المصدقة مسبقاً وختمها بطبق الأصل، التصديق على الشهادة الحائطية وكشوف الدرجات: وهي خدمة ختم الشهادة الحائطية وكشوف الدرجات للطلبة بعد إصدار إفادة مصدقة على المؤهل العلمي، التصديق على وثائق انسحاب الطالب، التصديق على وثائق إثبات قيد الطالب، التصديق على وثائق الطالب الزائر والنظر في الشكاوى المقدمة من الطلبة والعمل على معالجتها بالتنسيق مع مؤسساتهم التعليمية، ويتم ذلك من خلال ملء الاستمارة الخاصة بالشكاوى وإرفاقها بالوثائق والمستندات.

أما فيما يتعلق بالخدمات المؤسسية فهي تشمل إجراءات الترخيص، إجراءات الاستقدام، إجراءات التوظيف، إجراءات الترخيص لإعلان، إجراءات الاعتماد الأكاديمي والاستمارات المستخدمة لاستكمال الإجراءات والتي تشمل استمارة الترخيص لإعلان، استمارة الاستقدام واستمارة التوظيف/ تجديد التوظيف.

وفي الوقت الذي تتلخص خدمة تسهيل مهام باحث في الموافقة على تطبيق أدوات بحث أو دراسة بوزارة التربية والتعليم أو مدارسها، أو توفير بيانات لازمة لأغراض الدراسة، يقدم مجلس التعليم العالي أيضاً خدمة المسح الوطني السنوي للمهارات المطلوبة في سوق العمل، إذ يشير إلى أن الأمانة العامة للمجلس تجسر الفجوة بين مهارات الخريجين ومتطلبات سوق العمل في البحرين، إذ أظهرت بيانات من دراسات مختلفة بأن الخريجين لا يلبون توقعات أصحاب العمل في البحرين، وبالمثل فإن الخريجين يشعرون بأن التعليم العالي لم يؤهلهم لسوق العمل (دراسة القدرات، 2013).

ويأتي هذا المسح لدراسة وفهم عدة مهارات بشكل أفضل مثل (حل المشكلات، التفكير الناقد، مهارات التواصل، العمل الجماعي، الحساب والسرعة العقلية،...) وهي مهارات مطلوبة ورئيسة لسوق العمل. يشار إلى أن هذه الدراسة تعدّ إحدى مشاريع اللجنة التنسيقية بين قطاع التعليم العالي وقطاع الصناعة والأعمال في البحرين.